RIP-seq送样建议-威尼·至尊国际(中国)
    1. 威尼·至尊国际(中国)

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      送样建议

      RNA IP-seq(RIP-seq)

      声明:
      实验室科服业务不接收人间传染的病原微生物目录.pdf中实验活动需在BSL-2及以上实验等级的样本。名录中实验活动需BSL-1实验等级的样本,在送样前需给予样本无感染性或经灭活的声明无潜在感染风险的声明 (中英文).doc。对于高毒性动植物等样品,必须事先顺利获得销售、客服或运营经理与威尼·至尊国际(中国)技术人员联系,确定无高致病性和传染性后才能寄送样品。
      提取风险提示和注意事项:核酸提取质量与物种及组织部位、采集方法及保存状态、提取方法及操作、实验器材及环境等因素均有密不可分的联系,尤其是三代超长提取对样本的要求更高。组织提取时可能受到上下游处理操作的影响,因此较难保证单次提取满足质量要求,客户应在寄送组织样品前进行备份。为了保障取得高质量的核酸,请务必按照送样手册所规定的准备样本。对珍贵样本或者微量样本,建议自行提取。取样过程中,需要全程佩戴手套,并且使用预冷乙醇对取样器材进行擦拭消毒,以免样本污染。

      1.送样建议

      • 样本类型 送样量 注意事项
        自行送IP产物 IP后产物,不需要公司去除
        rRNA,不需要公司打断片段
        IP 产物/Input样本送样量:单次建库大于20 ng,浓度大于1 ng/μl,插入片段大小分布建议在250-300 bp。 建议客户在IP过程中自行去除rRNA,
        且 IP后产物插入片段建议分布在
        250-300bp,威尼·至尊国际(中国)接收样品后
        会检测样品的总量和纯度,以诺禾
        致源检测结果为准。
        IP后产物,需要公司去除rRNA,
        不需要公司打断片段
        IP 产物/Input样本送样量:单次建库大于50 ng,浓度大于1 ng/μl,插入片段大小分布建议在250-300 bp。
        IP后产物,需要公司去除rRNA,
        需要公司打断片段为250-300bp
        IP 产物/Input样本送样量:单次建库大于50 ng,浓度大于1 ng/μl。
        IP后产物,不需要公司去除
        rRNA,需要公司打断片段为
        250-300bp
        IP 产物/Input样本送样量:单次建库大于20 ng,浓度大于1 ng/μl。

      2.项目流程须知

      3.注意事项

      (1)二倍体,有参考基因组(拼接到染色体水平),注释完整(基因水平,有外显子、内含子、CDS);
      (2)若无特殊需求,建议老师的IP产物中去除rRNA(因为rRNA占比约在80%以上,会严重影响后续测序得到的有效数据量)。

      4 样本打包及寄送建议

      • 4.1 样本的打包

        (1)核酸样品建议使用质量好的1.5ml或2ml 低吸附EP管装载样品,并用封口膜封口。为了防止样品管破裂,或者污染和混乱,请不要使用诸如PCR管、0.5ml EP管、八联管、96孔板、深孔板等非标准管送样。非标准管不利于样品保存以及后续实验的进行。如有样品使用非标准管制备,还请在送样前自行转管处理。
        (2)组织样本建议根据送样量使用合适规格带螺纹帽的EP管、冻存管或者离心管装载组织样品,并用封口膜封口。
        (3)为防止样品管在运输过程中受到干冰挤压破裂,最好将样品管放到50ml离心管或其他支撑物中,并在支撑物里添加棉花或卫生纸缓冲。大量样品建议将EP管放置在冻存盒中,并在冻存盒外面包裹气泡垫。如使用锡箔纸、自封袋装载的样品,为防止运输中受挤压破损,建议将锡箔纸折叠整齐装在自封袋中,在样品包装外再用气泡垫包好并固定。
        (4)对于血液样品,建议采用5-10ml 塑料抗凝采血管装载,为了防止运输过程中采血管因挤压而损坏,需要将每支采血管管身均用气泡垫包好,然后放置到塑料或纸质包装盒中。
        (5)用乙醇沉淀的样品由于运输中会有少量乙醇挥发出,建议将样品管盖用封口膜缠绕4-5圈。
        (6)为便于处理和保存,组织样品送样量请不要超过建议送样量的5倍(特殊的得率较低的样品除外)。
      • 4.2 样本的名称标识

        (1)所有的样品必须具有清晰的标记,并且简洁明了。
        (2)使用锡箔纸包装的组织样品建议在锡箔纸内外均标记样品名称,并将锡箔纸放在自封袋中,自封袋外面再标记上样品名称,防止锡箔纸上样品名称模糊引起样品混乱。
        (3)使用乙醇沉淀的核酸样品,由于挥发出的乙醇会使记号笔的标记模糊,建议用油性记号笔将样品名称写在标签纸上,然后用透明胶带将标签纸粘贴在样品管壁上,并缠绕2-3圈。
        (4)样品名称建议使用“字母+数字”命名方式标注在管盖。其他信息如日期、浓度、物种等可标注在管壁。所有标注内容需与《样品信息单》保持一致。

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